微波對陶瓷、玻璃、塑料等具有穿透性，對金屬具有反射性，對水、含水物質、脂肪等具有深層瞬時加熱作用，產生熱效應。
 

　　就液體而言，微波僅對其中的極性分子其作用，微波電磁場能使極性分子產生告訴的旋轉而產生熱效應，同時改變體系的熱力學函數，降低反應的活化能和分子的化學鍵強度；對固體來說，許多磁性物質如過濾金屬及其化合物、活性碳等對微波有很強的吸收能力，由于其表面的不均勻性，微波輻射時其表面會產生許多“熱點”，這些“熱點”的能量比其他部位高得多，常被作為誘導化學反應的催化劑。
 

　　1、加熱機理：污水中含有大量的有機污染物、無機污染物、污泥等，這些物質可對環境產生嚴重的污染。利用微波的加熱特性，可將微波技術有效地用于污泥、有機污染物的處理及有機絮凝劑的制備。
 

　　微波加熱是利用介質的介電損耗而發熱，在極短的時間內使介質分子達到極化狀態，加劇分子的運動與碰撞。由于電磁能量是以波的形式輻射到介質內部，內外同時加熱，加熱無滯后效應，所以體系受熱均勻，可大大加快反應速度，縮短反應周期。如在生活污水處理過程中，可采用微波加熱來代替傳統加熱使污泥脫水和干燥。污水處理中常用活性碳吸附法，但吸附后的活性碳表面有機物卻難以處理。
 

　　微波輻射能有效地解吸活性碳表面的有機物，使活性碳再生并有利于有機物的消解和回收再利用。采用微波解吸處理污水中的有機物，不僅可消解有機物，還可獲得高質量的回收產物。
 

　　2、生物殺菌機理：微波殺菌是制造一個屋里環境使微生物死亡，這個環境包括熱力的溫度場合頻率*的交變電磁場。兩種屋里場共同作用于生物固體中的微生物，從而達到殺菌的效果，同時，微波對腸道細菌、蠕蟲寄生蟲和部分病菌都有殺菌作用，具有良好的應用前景。
 

　　微波電磁場作用于生物體，能引起兩類生物效應：一類是熱效應，指生物體內各層次的生物物質吸收電磁波后轉變為熱能，溫度升高并由此而引起生理和病理變化的作用；還有一類為非熱效應，指電磁場通過使生物體溫度升高的熱作用以新的方式改變生理生化過程的效應。
 

　　微波作用能改變生物性排列聚合狀態及其運動規律，而且微波場感應的離子流，會影響細胞膜附近的電荷分布，導致膜的屏障作用受到損傷，產生膜功能障礙，從而干擾或破壞細胞的正常新陳代謝功能，導致細菌生長抑制、停止或死亡。
 

　　總之，微波對流體中的物質選擇性加熱，對吸波物質低溫催化、低溫殺菌和均勻加熱的功能，加速了固、液分離作用，達到去污除濁殺菌的功效，經微波技術處理后的水可全部回用，運行穩定可靠。